Pristanišče je postalo glavno pristanišče v dinastiji Song. Naravno pristanišče je globoko in lahko sprejme največje ladje z več kot 100.000 ton. Za obrambo otoka pred Japonci je princ Zhou Dexing mesto Xiamen ogradil s 110 kilometri močno utrjenega obzidja.
Starodavni zid je bil uničen leta 1928, vendar lahko vidite ostanke na nekaterih mestih, kot je univerza Xiamen. Ta zid je bil uporabljen za preprečevanje Japoncev, vendar ni mogel preprečiti Evropejcev. Sprva so prišli kot trgovci.
Potem, ko so Mongoli vdrli in ustanovili dinastijo Qing, je znana oseba po imenu Koxinga, ki se je rodila leta 1629 v Hiradu na Japonskem, postavila ozemlje na območju zunaj nadzora Qing. Boril se je proti četam Qing in tudi pregnal Nizozemce s Tajvana. Ko je imel nadzor, se je ime ozemlja imenovalo Siming, kar pomeni 'Zapomni si Ming'.
Zdaj je to ime okrožja v Xiamenu. Nizozemci so kolonizirali Tajvan. Tako je 21. aprila 1661 odplul z več deset tisoč vojaki (morda 25.000), Nizozemci pa so se predali 27. januarja 1662. Po teh zmagah je znan tako na Kitajskem kot na Tajvanu. Koxinga je kmalu po tem umrl, nato pa je dinastija Qing prevzela območje Xiamen.
Leta 1902 je bilo na območju lokalno oblast, sestavljena iz tujcev. V mednarodni poravnavi so bili tujci iz številnih držav, tam pa je imelo konzulate štirinajst držav. Leta 1939 so Japonci želeli vdreti na območje, a zaradi prisotnosti tujih čet niso mogli. Leta 1941 so Japonci nadzorovali območje.
Leta 1980 je postala ena od prvih štirih posebnih gospodarskih con na Kitajskem, kjer so bile dovoljene tuje naložbe in mednarodna trgovina. Po tem je mesto postalo uspešno. Mesto se za rast močno zanaša na zunanjo trgovino in naložbe. Je ključno pristanišče za trgovino s Tajvanom in je pomemben prehod za Tajvance za obisk Kitajske.